El manuscrito inédito de la tercera obra Descripción de distintas especies de aves del Reino de la Nueva España, según sus órdenes y familias, de la Real Expedición fue descubierto apenas en 1997 por Miguel Ángel Puig y Graciela Zamudio en el Museo Nacional de Ciencias Naturales de Madrid. Esta obra contiene 290 descripciones de especies ornitológicas, escritas también en latín. En 1981, aparecieron en Barcelona, en manos de la familia Torner, más de dos mil acuarelas originales, productos de esta Real Expedición, a los que se les conoce como la Colección Torner, que se encuentra custodiada por el Hunt Institute for Botanical Documentation, en Pittsburgh, Philadelphia; sesenta de ellas pertenecen al Real Jardín Botánico del Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC), en Madrid, España.
Dos años antes, en 1979, se identificaron, también en Barcelona, 80 láminas originales de aves, hechas por los mismos artistas.